Evaluating Evo 2 for plant variant effect prediction
이 논문은 Evo 2 모델이 실험적으로 검증된 Arabidopsis thaliana 변이를 통해 기능적 영향을 구별할 수 있음을 입증하고, 새로운 지수 반전 진폭 지표를 결합하여 식물 GWAS 및 QTL 매핑에서 인과 변이 우선순위 결정에 큰 잠재력을 보여준다고 요약할 수 있습니다.
📄 Category
plant biology
300 편의 논문
Endogenous RALF peptide function is required for powdery mildew host colonization
본 연구는 애기장대 가루곰팡이 (Erysiphe cruciferarum) 가 숙주 식물에 성공적으로 감염되기 위해 숙주 내생 RALF 펩타이드가 매개하는 세포벽 재구성과 아포플라스트 pH 항상성 조절이 필수적임을 규명하여, 이 과정이 FER 수용체 의존적이지 않을 수도 있음을 시사합니다.
Phyllosphere microbiome-based biocontrol solution against Botrytis cinerea and Plasmopara viticola in grapevine
본 연구는 포도나무 잎 표면에서 분리된 미생물 군집이 단일 균주보다 더 강력한 항균 및 식물 면역 유도 효과를 발휘하여 회색곰팡이병과 downy mildew 를 효과적으로 억제할 수 있는 지속 가능한 생물학적 방제 솔루션임을 규명했습니다.
Metagenomics analysis for microbial ecology investigation on historical samples: negligible effect of host DNA and optimal analysis strategies
이 연구는 역사적 샘플에서 숙주 DNA 제거가 미생물 생태 분석에 큰 영향을 미치지 않으며, 다양한 길이의 읽기를 효과적으로 처리하기 위해 긴 k-mer 와 짧은 k-mer 를 모두 사용하는 2 단계 분류 전략이 기존 워크플로우보다 우수함을 입증하여 자연사 표본을 미생물군집 연구에 활용하는 기반을 마련했습니다.
In vitro evaluation of protein-protein interactions in the rice KAI2 ligand signaling complex
이 논문은 새로운 KAI2-리간드 유사체인 dMGer 을 이용해 인위적으로 rice D14L, D3, OsSMAX1 간의 물리적 상호작용을 규명하고, 리간드가 신호 전달 복합체 형성에 핵심적인 역할을 하며 OsSMAX1 과 D53 을 구분하는 도메인을 확인함으로써 KAI2 신호 전달 경로의 분자적 기작을 제시했습니다.
A three amino acid sequence gates protein stability control of bHLH104 and iron uptake in Arabidopsis thaliana
이 연구는 Arabidopsis thaliana 의 철 흡수 조절 인자 bHLH104 의 C 말단 3 개 아미노산 서열 (PAA) 이 E3 리가제 BTS 에 의한 분해 및 단백질 안정성 조절에 필수적임을 규명함으로써, 이 서열을 표적으로 한 작물의 철 생체농축 전략 가능성을 제시했습니다.
Larval antibiosis to cabbage stem flea beetle (Psylliodes chrysocephala) is absent within oilseed rape (Brassica napus)
이 연구는 배추혹파리의 유충에 대한 항생성 저항성이 가축화 과정의 병목 현상으로 인해 유채 (Brassica napus) 에서는 발견되지 않았으나, 흰무 (Sinapis alba) 에서는 확인되었으며, 모델 식물 종을 활용한 유충 스크리닝이 향후 유채의 저항성 육종에 중요한 단서를 제공할 수 있음을 규명했습니다.
Reference genome assembly of a tetraploid accession of the tuber crop Tropaeolum tuberosum
이 논문은 파키소드 (PacBio) HiFi 시퀀싱을 활용하여 안데스 지역 고랭지 작물인 마카 (Tropaeolum tuberosum) 의 4 배체 접근군에 대한 고품질 참조 유전체 어셈블리를 구축하고, 이를 현장 채집된 유전자원과의 비교를 통해 검증함으로써 해당 작물의 육종 및 보전을 위한 기초 유전체 자원을 마련했다는 내용을 담고 있습니다.
Presymptomatic plant disease detection with PSNet: A low-cost hyperspectral imaging and RGB fusion framework.
이 논문은 3D 프린팅 하우징을 활용한 500 파운드 미만의 저비용 초분광 카메라와 RGB 정보를 융합한 PSNet 프레임워크를 통해, 가시적 증상이 나타나기 전에도 Arabidopsis thaliana 의 흰가루병을 90% 이상의 정확도로 조기 감지할 수 있음을 입증했습니다.
Utilizing raw rapeseed press cake in foods: A case study on sensory quality and profile of selected bitter compounds in snack bars
이 연구는 생선유채박을 스낵바에 첨가했을 때 농도에 따른 감각적 특성과 KSS, 고이트린 등 특정 대사산물이 쓴맛과 수렴성에 미치는 영향을 규명하여 생선유채박의 식품 활용 가능성과 신품종 육종의 기초를 마련했습니다.
Effector-centred proximity-dependent labelling enables the discovery of cell-surface immune receptors in plants
본 연구는 TurboID 기반의 효과자 중심 근접 라벨링 기술을 개발하여 식물 세포 표면의 면역 수용체와 병원균 효과자의 직접적·간접적 표적을 식물 내에서 성공적으로 규명함으로써 작물의 저항성 유전자 발견을 가속화할 수 있는 확장 가능한 접근법을 제시했습니다.
Transposons Triggered Dynamic Evolution of MKK3 Gene, a Key Regulator for Seed Dormancy in Barley
본 연구는 트랜스포존이 보리 종자 휴면의 핵심 조절자인 MKK3 유전자의 동적 진화와 전 세계적 확산을 주도했으며, 이를 통해 보리 품종별 휴면 특성의 기원과 개량에 대한 중요한 통찰을 제공함을 밝혔습니다.
Characterizing key osmolytes and osmoprotectants in drought-stressed Scotch pine: a differential approach
이 연구는 건조 스트레스를 받은 소나무를 대상으로 대사체 분석 및 수분 상태 모니터링을 결합한 차별적 접근법을 통해, 트립토판·발린·라이신과 같은 아미노산이 삼투보호제 역할을 하고 유기산이 삼투조절의 주된 기작임을 규명했습니다.
Effects of agroforestry trees on microclimate and enset (Ensete ventricosum) morphophysiology in South Ethiopia
본 연구는 남부 에티오피아에서 분산된 교목이 미기후를 완화하고 에네트 (Ensete ventricosum) 의 생리·형태적 특성을 개선하여 에네트 기반의 농림업 시스템 확장에 대한 잠재력을 확인했다고 요약할 수 있습니다.
Evolutionary analysis of the exocyst in streptophytes links EXO70 diversification to dominance over SEC3 in membrane targeting
이 연구는 식물 육상화 초기에 EXO70 의 다양화가 시작되었고, 막 표적화 기능이 SEC3 에서 EXO70 으로 이동하면서 EXO70 아형별 특이적 재취합과 전문화된 분비 경로의 출현이 가능해졌음을 규명했습니다.
PIFI Stabilizes Chloroplast NDH-PSI Supercomplex to Maintain Plastoquinone Redox Balance and PSII Efficiency
본 연구는 PIFI 단백질이 NDH-PSI 초복합체의 안정화를 통해 엽록체 내 플라스토키논의 산화환원 균형을 유지하고 광계 II 의 효율을 보존하는 데 필수적임을 규명했습니다.
PHOTOTROPIN-mediated blue light signaling orients the asymmetry of Marchantia polymorpha spores
이 논문은 광수용체 PHOTOTROPIN 과 NCH1 에 의존하는 청색광 신호가 우연성 생식체인 Marchantia polymorpha 의 비대칭 세포 분열 방향을 결정하여 초기 발달 축의 배향을 설정한다는 것을 규명했습니다.
Physiological responses of submerged freshwater macrophytes to multiple stressors
이 연구는 124 개 실험을 메타분석하여 침수성 수생식물이 여러 환경 스트레스 요인에 주로 가산적 영향을 받으며, 특히 금속과 다른 스트레스 요인의 결합 시 상승작용이 발생할 수 있음을 규명하고, 향후 예측 정확도를 높이기 위해 Stuckenia pectinata 를 모델 생물로 활용하고 실험의 복잡성과 다양성을 확대할 것을 제안합니다.
Cytosolic MAPK signaling gates chloroplast protein import and photosynthetic capacity
이 논문은 세포질 MAPK 신호전달 경로가 ACTPK1 과 RbcS 전이 펩타이드의 인산화를 조절하여 엽록체 단백질 수송과 광합성 능력을 동적으로 제어한다는 새로운 기작을 규명했습니다.
Structure of the Arabidopsis receptor kinase SRF6 ectodomain determined from crystals obtained using the LRR crystallisation screen
이 논문은 LRR 결정화 스크린을 활용하여 1.5 Å 해상도로 아라비디옵시스 SRF6 수용체 키네이스의 ectodomain 구조를 규명하고, 기존에 보고된 단백질 상호작용이 확인되지 않아 SRF6 가 브라스티노이드 경로 외의 신호 전달 기능을 가질 가능성을 제시했습니다.